====== Uso da Linguagem R para Análise de Dados em Ecologia ======

== "Uma das coisas mais importantes que você pode fazer é dedicar um tempo para aprender uma liguagem de programação de verdade. Aprender a programar é como aprender outro idioma: exige tempo e treinamento, e não há resultados práticos imediatos. Mas se você supera essa primeira subida íngreme da curva de aprendizado, os ganhos como cientista são enormes. Programar não vai apenas livrar você da camisa de força dos pacotes estatísticos, mas também irá aguçar suas habilidades analíticas e ampliar os horizontes de modelagem ecológica e estatística." ==
//Tradução um tanto livre de Gotelli & Ellison, 2004. A Primer of Ecological Statistics. Sunderland, Sinauer.//


== "A chave para entender o R é que trata-se de uma linguagem. Uma linguagem para manipular objetos" ==
//[[http://www.cmis.csiro.au/bill.venables/|Bill Venables]]//

== " A pergunta certa sobre uma análise em R não é se é possível fazê-la, e sim como fazê-la."==
//[[http://leg.ufpr.br/~paulojus/|Paulo Justiniano Ribeiro]]//

== "Tudo que ensinas a uma criança, impede-a de descobrir" ==
//Jean Piaget//

===== Objetivos =====

  - Demonstrar o potencial de uso da linguagem R para análises estatísticas em projetos de pesquisa em ecologia.
  - Propiciar aos alunos o entendimento do funcionamento do ambiente de trabalho do R e de sua filosofia de análise de dados.
  - Tornar os alunos proficientes em algumas ferramentas básicas de análise estatístico com a linguagem R.







===== Programa =====


  * [[01-introducao|1. Introdução:]] histórico e filosofia de trabalho do R, breve histórico da linguagem S e do R, exemplo de uma sessão de trabalho no R.

  * [[02-entrada|2. Primeiros passos:]] interação com programa, sintaxe e comandos, como obter ajuda.

  * [[03-funcoes|3. Funções no R e sua Aplicação:]] funções matemáticas, funções estatísticas e operações lógicas. 

  * [[04-dados|4. Leitura e Manipulação de Dados:]] tipos de variáveis e de estrutura dos dados, entrada e importação de dados, transformações de dados, operações vetoriais e matriciais, indexação.

  * [[05-exploratoria|5. Análise Exploratória de Dados:]] estatísticas descritivas, gráficos exploratórios.

  * [[06-modelos|6. Modelos Lineares:]] lógica geral em R, regressão linear, análise de variância, verificação das pressuposições dos modelos lineares.

  * [[07-programar|7. Noções de Programação em Linguagem S:]] fundamentos de programação orientada a objetos; lógica e controle de fluxo em linguagem S; procedimentos vetoriais de programação.

  * [[08-simulacao|8. Simulação e Reamostragem:]] funções ligadas às distribuições de probabilidade, simulação de distribuições, reamostragem de dados.


===== Arquivos de Dados =====

Alguns arquivos de dados que utilizados no curso:
  * [[dados-caixeta| Levantamento em 3 caixetais do Estado de São Paulo.]]
  * [[dados-esaligna| Medidas de biomassa de árvores de Eucalyptus saligna.]]
  * [[dados-egrandis| Inventário em Florestas Plantadas de Eucalyptus grandis.]]
  * [[dados-mudas| Experimento do efeito de substratos sobre o crescimento de mudas em viveiro.]]
  * [[dados-mamifs| Ocorrência de mamíferos em topos de montanhas da Great Basin]]
  * [[dados-asteraceae| Espécies de insetos criados de capítulos de Asteraceae]]
  * [[dados-animals|Massa corporal e cerebral de alguns animais]]