biometria:rformen:roteiros
Roteiros para Análises no R
Tabela Fitossociológica
- Roteiro: Roteiro no R
> # Visão do início dos dados > head(galia) plot species dbh 1 1 Boehmeria caudata 12.0 2 1 Cabralea canjerana 19.1 3 1 Boehmeria caudata 7.1 4 1 Sapium glandulatum 57.2 5 1 Syagrus romanzoffiana 26.7 6 1 Cupania vernalis 8.5 > > # Cálculo da densidade > dens = aggregate( galia$dbh, list(sp=galia$species), length ) > names(dens)[2] = "densidade" # acrescenta o nome correto à variável "x" > head(dens) sp densidade 1 Acacia polyphylla 1 2 Actinostemon concepcionis 1 3 Actinostemon concolor 16 4 Aspidosperma polyneuron 3 5 Boehmeria caudata 2 6 Cabralea canjerana 2 > > # Cálculo da Dominância > dom = aggregate( (pi/4)*galia$dbh^2, list(sp=galia$species), sum ) > names(dom)[2] = "dominancia" # acrescenta o nome correto à variável "x" > head(dom) sp dominancia 1 Acacia polyphylla 22.90221 2 Actinostemon concepcionis 51.52997 3 Actinostemon concolor 470.36711 4 Aspidosperma polyneuron 1218.03474 5 Boehmeria caudata 152.68926 6 Cabralea canjerana 307.75827 > > # Cálculo da Frequência > freq = aggregate( galia$plot, list(sp=galia$species), function(x) length(unique(x)) ) > names(freq)[2] = "frequencia" # acrescenta o nome correto à variável "x" > head(freq) sp frequencia 1 Acacia polyphylla 1 2 Actinostemon concepcionis 1 3 Actinostemon concolor 6 4 Aspidosperma polyneuron 3 5 Boehmeria caudata 1 6 Cabralea canjerana 2 > > # Junta as variáveis num "data.frame" > fitosoc = merge(merge(dens,dom),freq) > head(fitosoc) sp densidade dominancia frequencia 1 Acacia polyphylla 1 22.90221 1 2 Actinostemon concepcionis 1 51.52997 1 3 Actinostemon concolor 16 470.36711 6 4 Aspidosperma polyneuron 3 1218.03474 3 5 Boehmeria caudata 2 152.68926 1 6 Cabralea canjerana 2 307.75827 2 >
- Notas:
- Faça as devidas adaptações para os nomes das variáveis.
- Não esqueça as transformações de unidades para que os valores de densidade e dominância seja apresentados em unidades apropriadas.
- Valores relativos de densidade, dominância e frequência, bem como os famigerados IVI e IVC, seguem facilmente a partir desses cálculos.
biometria/rformen/roteiros.txt · Última modificação: 2022/11/24 14:21 por 127.0.0.1