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biometria:rformen:roteiros

Roteiros para Análises no R

Tabela Fitossociológica

  • Roteiro: Roteiro no R
> #  Visão do início dos dados
> head(galia)
  plot               species  dbh
1    1     Boehmeria caudata 12.0
2    1   Cabralea canjerana  19.1
3    1     Boehmeria caudata  7.1
4    1    Sapium glandulatum 57.2
5    1 Syagrus romanzoffiana 26.7
6    1      Cupania vernalis  8.5
> 
> # Cálculo da densidade
> dens = aggregate( galia$dbh, list(sp=galia$species), length )
> names(dens)[2] = "densidade"   # acrescenta o nome correto à variável "x"
> head(dens)
                          sp densidade
1          Acacia polyphylla         1
2 Actinostemon concepcionis          1
3      Actinostemon concolor        16
4   Aspidosperma polyneuron          3
5          Boehmeria caudata         2
6        Cabralea canjerana          2
> 
> # Cálculo da Dominância
> dom = aggregate( (pi/4)*galia$dbh^2, list(sp=galia$species), sum )
> names(dom)[2] = "dominancia"   # acrescenta o nome correto à variável "x"
> head(dom)
                          sp dominancia
1          Acacia polyphylla   22.90221
2 Actinostemon concepcionis    51.52997
3      Actinostemon concolor  470.36711
4   Aspidosperma polyneuron  1218.03474
5          Boehmeria caudata  152.68926
6        Cabralea canjerana   307.75827
> 
> # Cálculo da Frequência
> freq = aggregate( galia$plot, list(sp=galia$species), function(x) length(unique(x)) )
> names(freq)[2] = "frequencia"   # acrescenta o nome correto à variável "x"
> head(freq)
                          sp frequencia
1          Acacia polyphylla          1
2 Actinostemon concepcionis           1
3      Actinostemon concolor          6
4   Aspidosperma polyneuron           3
5          Boehmeria caudata          1
6        Cabralea canjerana           2
> 
> # Junta as variáveis num "data.frame"
> fitosoc = merge(merge(dens,dom),freq)
> head(fitosoc)
                          sp densidade dominancia frequencia
1          Acacia polyphylla         1   22.90221          1
2 Actinostemon concepcionis          1   51.52997          1
3      Actinostemon concolor        16  470.36711          6
4   Aspidosperma polyneuron          3 1218.03474          3
5          Boehmeria caudata         2  152.68926          1
6        Cabralea canjerana          2  307.75827          2
> 
  • Notas:
    1. Faça as devidas adaptações para os nomes das variáveis.
    2. Não esqueça as transformações de unidades para que os valores de densidade e dominância seja apresentados em unidades apropriadas.
    3. Valores relativos de densidade, dominância e frequência, bem como os famigerados IVI e IVC, seguem facilmente a partir desses cálculos.
biometria/rformen/roteiros.txt · Última modificação: 2022/11/24 14:21 por 127.0.0.1