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biometria:encontros:start
 CMQ: Centro de Métodos Quantitativos LaBE - Laboratório de Biometria Ecológica
Centro de Métodos Quantitativos
Departamento de Ciências Florestais
Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”
UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO
Árvore da Vida


Laboratório de Biometria Ecológica (LaBE)

ENCONTROS

PROJETOS IBS 2010: "Todos para Floripa!"

Projeto 1: AIC e Multicolinaridade

Semana 30/03/2010 PARSIVAL

Função correta (espero!!) para cálculo do AIC em modelos com transformação logarítmitca:

# Computing the AIC for log-transformed models
log.AIC <- function(lmobj, k = 2)
{
#
# log.AIC = computes AIC for log-transformed linear model
#
#
	y.log = lmobj$model[,1]
	Y = exp( y.log )
	jacobian = 1/Y

	yhat = lmobj$fitted
	sigma = summary(lmobj)$sigma
	p = length( lmobj$coefficients ) + 1

	llik = log( dnorm( y.log, mean=yhat, sd=sigma) * jacobian )

	AIC = -2 * sum(llik) + k*p

	return(AIC)
}


Semana 27/11/2009 PARSIVAL

Pessoal os primeiros conjuntos de dados: volume-arvores.RData

  • Esse arquivo é carregado dentro do R com o comando load.
  • Uma série de objetos (sensu R) serão criados na área de trabalho.
  • O objeto “df.descrip” (data.frame, também) apresenta breve descrição dos conjuntos.
  • Todos os demais objetos são data.frames com os conjuntos de dados (17 ao todo).

O primeiro conjunto de tarefas é ajustar os modelos de equação de volume (dupla entrada) a todos conjuntos de dados. utilizando a função lm; o Edgar será o “monitor”.

Semana 03/12/2009 PARSIVAL

Códigos do R:

Apostila de regressão linear applied-regression.pdf

Tarefas:

  • re-organizar os dados num único diretório utilizando listas de modelos;
  • construir função para “automatizar” o cálculo de: (1) máximo VIF e (2) maximum condition index;
  • realizar as computações de AIC, máximo VIF e maximum condition index para todos modelos em todos conjuntos de dados.
  • construir uma tabela com: conjunto de dados, modelos e os índices.

Aprendizado do R

Tarefas

Uso do “merge” e do “agregate”

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